数学与数学教育研究所成立于1983年，目前有5个博士点学科：基础数学、计算数学、概率论与数理统计、应用数学、课程与教学论；7个硕士点学科：基础数学、计算数学、概率论与数理统计、应用数学、课程与教学论、学科教学(数学)、计算机软件与理论。
1988年，基础数学、概率论与数理统计被评为国家重点学科。1990年建立了北京师范大学第一个博士后流动站。1996年，数学学科成为国家211工程重点建设的学科。1997年成为国家基础科学人才培养基金基地。1998年获数学一级学科博士学位授予权。2001年概率论方向被评为国家自然科学基金创新群体。2005年进入“985工程”科技创新基础建设平台。2007年数学被评为一级学科国家重点学科。2009年教育部数学与复杂系统重点实验室挂牌，调和分析与流形的几何方向被评为教育部创新团队。2016年，在高校第4轮数学一级学科评估中排名A类。2017年，进入世界一流建设学科名单。
数学与数学教育研究所将继续发展特色和优势学科，聚焦国际前沿重要研究领域，引领关键方向的自主创新研究，促进数学各研究方向的深度交叉融合；以世界一流为目标，建设高水平的研究队伍，增强学科建设发展后劲；推进国际交流与合作，提升学科综合实力和国际竞争力；开展数学教育的研究与实践，推动国家数学教育事业的改革与发展。
